王様のもとに持ち込まれたジミニーのメモには、身に覚えのないメッセージが書かれていた。この謎を解くため、データ世界のソラの冒険が始まる。

データ世界に散らばったバグを取り除き、修復されていくデータ。しかし記録にない黒いコートの人物がソラの前に現れる——

アクションRPGとして多様なシステムを採用。ステージによってシューティング・パズル・サイドスクロールなどジャンルが変化するユニークな構成になっている。

システム変化	ステージごとに異なるゲームジャンルで進行する。
バグブロック	フィールドに散らばるバグを取り除きながら進む。
アバターメニュー	プレイヤーキャラのカスタマイズ要素がある。

KH3Dに繋がるとともに、KH3以降にも関係していくと考察されている重要な作品。「HD 1.5+2.5 ReMIX」に映像収録済み。