マスター承認試験を翌日に控えたテラ、ヴェントゥス、アクアは満点の星空の下で語り合う。

翌日、テラとアクアはエラクゥスとゼアノート立ち合いのもと、マスター承認試験が始まった。心のありようを試すものだったが、テラは咄嗟に闇の力を発動してしまう

闇の力に思い悩むテラに、ゼアノートは闇を制するよう助言した。自分の良き理解者としてゼアノートに信頼感を抱く。

一方ヴェントゥスは仮面を被った少年と対面し、彼の不安を仰ぐような言葉を耳にする。その言葉に駆られ、ヴェントゥスはテラの跡を追いかけ、旅立ちの地を飛び出す。

コマンドデッキシステムを採用。攻撃・魔法・アビリティをデッキに組み込み、連続使用でコマンドスタイルが発動する爽快なバトルが特徴。

コマンドバトル	攻撃や魔法をデッキに登録。連続使用でスタイル変化が起きる。
コマンドスタイル	特定のコマンドを連続使用するとコマンドゲージが増加し、強力な変身状態に突入。
D-Link	特定のキャラクターとリンクし、専用コマンドを使用できる。
シュートロック	フォーカスゲージを消費して、ロックオンした敵に一斉攻撃。
ミラージュアリーナ	アリーナモードで敵と戦ったり、コマンドボードやランブルレーシングなどで遊ぶことが可能。
シュートロック	フォーカスゲージを消費して、ロックオンした敵に一斉攻撃。

シリーズの「なぜ」のほとんどはこの作品に答えがある。テラ・アクア・ヴェントゥスの運命を知らずしてKH3の感動は味わえない。「HD 2.5 ReMIX」で快適に遊べる。